《本草万方针线》是清代医学家蔡烈先编纂的一部医学工具书，全称“本草万方针线”，亦称“本草验方针线”。这部作品是蔡烈先对李时珍《本草纲目》中所附的单方进行重新分类和整理的成果，其目的在于方便医学工作者和学者快速检索《本草纲目》中的方剂。蔡烈先在《自叙》中提到，他从顺治己丑年（1649年）三月起至顺治壬辰年（1652年）历时三年完成了这部作品 。
《本草万方针线》将《本草纲目》中的15000余首单方，按照病症分类编成索引，分为通治部、外科、女科、儿科、上部、中部、下部共七部，105门。每一病症都明确标注了《本草纲目》的卷数和页数，极大地提高了检索效率 。
蔡烈先，字承侯，号茧斋，是清代浙江山阴县人，在方剂学方面有很高的造诣。除了《本草万方针线》，他还著有《本草纲目》药品总录，这些作品对后世的医学研究产生了深远的影响 。
现存的《本草万方针线》有多种版本，包括清刻本和石印本。在贵州省图书馆藏有《本草万方针线八卷目录一卷本草药品总目五十二卷》的版本，为清金閶书业堂目录一卷刻本 。此外，河北省图书馆也藏有《本草万方针线八卷附本草药品总目一卷》的版本，为清康熙五十八年（1719年）刻本 。南京图书馆则藏有清光绪十一年张绍棠味古斋刻本的《本草万方针线八卷》 。
蔡烈先通过编纂《本草万方针线》，不仅提高了《本草纲目》的实用性，而且为后世医学研究者提供了极大的便利。他自豪地表示：“有《本草》者不可无此《针线》。家家有《本草》，有此《针线》，百病千方，顷刻可用，人尽医矣。于以救人，不无小补。”这表明蔡烈先编纂此书的目的是为了提高人们查阅《本草纲目》的速度，以利于治病救人 。
