《医事启源》是一部由日本医学家今村了庵于1862年撰写的医史著作。该书主要介绍了各种医学发明的起源历史，尤其是强调了中国古代医学对西医的某些先进方法的影响，如解剖、化学制药、麻醉等，共二十项 。今村了庵撰写此书的背景是西洋医学开始在日本盛行，他希望通过这本书尊崇和提倡汉医，同时指出西医的某些方法实际上源自中国古代医学 。
今村了庵是日本医学界的重要人物，他不仅撰写了《医事启源》，还有《伤寒论私考》、《金匮雕题》等多部医学著作 。《医事启源》的撰写动机，在于作者对汉医的深厚情感和对西医盛行的忧虑，他希望通过书中的内容展示汉医的完备性，以激励学医者对汉医的尊重和学习 。
该书的初刻本以及《皇汉医学丛书》本都已存在，1949年之后还有排印本 。今村了庵在书中提到，日本医学的发展受到了荷兰医学的影响，从享保年间开始，日本与荷兰的医学交流逐渐增多，到了文久元年，即《医事启源》撰写的年份，日本已经建立了西洋医学所 。
《医事启源》不仅在日本医学史上占有重要地位，对中医的传承和发展也具有启示意义。有学者认为，这本书对我国医家的启示和促进作用很大，特别是在西医日益受到冲击的情况下，它提醒我们不应忽视中医的先进性和创见性 。
